ca.cioos 473fe40d-613e-4aba-b335-7a31a04e5d69 Department of Fisheries and Oceans Ottawa Canada https://www.dfo-mpo.gc.ca WWW:LINK https://ror.org/02qa1x782 Clay, Stephanie Stephanie.Clay@dfo-mpo.gc.ca https://orcid.org/0000-0001-5113-2378 Department of Fisheries and Oceans Ottawa Canada https://www.dfo-mpo.gc.ca WWW:LINK https://ror.org/02qa1x782 Clay, Stephanie Stephanie.Clay@dfo-mpo.gc.ca https://orcid.org/0000-0001-5113-2378 Department of Fisheries and Oceans Ottawa Canada https://www.dfo-mpo.gc.ca WWW:LINK https://ror.org/02qa1x782 Clay, Stephanie Stephanie.Clay@dfo-mpo.gc.ca https://orcid.org/0000-0001-5113-2378 2025-09-02T18:33:55.714Z revision 2025-09-02 publication ISO 19115-1 Geographic information - Metadata First Edition 2014-04-01 ISO 19115-2 Geographic information - Metadata Second Edition 2019-01 ISO 19115-1 Geographic Information - Metadata Amendment 1 2018-02 Canadian Integrated Ocean Observing System Metadata Profile of ISO 19115 2019-11-06 publication Northwest Atlantic per-pixel spring bloom metrics derived from OC-CCI POLY4 satellite Chlorophyll-a Par-Pixel métriques de la floraison printanière dans l'Atlantique du Nord-ouest dérivées de la Chlorophylle-a satellitaire OC-CCI POLY-4 1998-01-01 creation 1.1 Department of Fisheries and Oceans Ottawa Canada https://www.dfo-mpo.gc.ca WWW:LINK https://ror.org/02qa1x782 Clay, Stephanie Stephanie.Clay@dfo-mpo.gc.ca https://orcid.org/0000-0001-5113-2378 Department of Fisheries and Oceans Ottawa Canada https://www.dfo-mpo.gc.ca WWW:LINK https://ror.org/02qa1x782 Clay, Stephanie Stephanie.Clay@dfo-mpo.gc.ca https://orcid.org/0000-0001-5113-2378 Department of Fisheries and Oceans Ottawa Canada https://www.dfo-mpo.gc.ca WWW:LINK https://ror.org/02qa1x782 Clay, Stephanie Stephanie.Clay@dfo-mpo.gc.ca https://orcid.org/0000-0001-5113-2378 Fisheries and Oceans Canada Ottawa Canada https://www.dfo-mpo.gc.ca WWW:LINK https://ror.org/02qa1x782 Devred, Emmanuel Emmanuel.Devred@dfo-mpo.gc.ca https://orcid.org/0000-0001-9446-0005 Fisheries and Oceans Canada Ottawa Canada https://www.dfo-mpo.gc.ca WWW:LINK https://ror.org/02qa1x782 Devred, Emmanuel Emmanuel.Devred@dfo-mpo.gc.ca https://orcid.org/0000-0001-9446-0005 This dataset contains the metrics derived from fitting a shifted Gaussian to the time series of daily 4km-resolution satellite-derived surface chlorophyll-a concentration (Chl-a) within a single pixel for a given year. The fitting procedure is the same as that used in the PhytoFit R-shiny application (https://github.com/BIO-RSG/PhytoFit) to model the spring phytoplankton bloom within a user-selected region of interest. The derived bloom metrics include the day of year of the start of the bloom and its duration, the maximum chl-a and the total chl-a produced during the bloom period, and the mean annual chl-a. Each year contains these five layers as well as two layers describing the quality of the data and the accuracy of the Gaussian fit. The metrics cover an area spanning the Northwest Atlantic (39-66°N, 42-76°W, excluding Hudson Strait) from 1998 to present. The chl-a data used in the time series were the regionally-tuned POLY4 chl-a derived from remote sensing reflectance data provided in the OC-CCI multisensor product (oceancolour.org), which were gap-filled using the DINEOF method (https://github.com/aida-alvera/DINEOF). These metrics can be used to inform on the state of the ecosystem in a particular area and its variability over time, which could have implications for higher trophic level dynamics. Ce jeu de données contient les mesures dérivées de l'ajustement d'une courbe gaussienne décalée à une série temporelle de concentrations quotidiennes de chlorophylle-a mesurées en surface (Chl-a) par dérivée par satellite avec une résolution de 4 km pour chaque pixel pour une année donnée. La procédure d'ajustement est la même que celle utilisée dans l'application PhytoFit R-shiny (https://github.com/BIO-RSG/PhytoFit) pour modéliser la floraison printanière de phytoplancton dans une région d'intérêt sélectionnée par l'utilisateur. Les paramètres dérivés de la floraison printanière comprennent le jour de l'année du début de la floraison et sa durée, la chl-a maximale et la chl-a totale produite pendant la période de floraison, ainsi que la chl-a annuelle moyenne. Chaque année contient ces cinq couches ainsi que deux couches décrivant la qualité des données et la précision de l'ajustement gaussien. Les mesures couvrent une zone s'étendant sur l'Atlantique Nord-Ouest (39-66°N, 42-76°O, à l'exclusion du détroit d'Hudson) de 1998 à aujourd'hui. Les données chl-a utilisées dans la série temporelles sont les données chl-a POLY4 ajustées au niveau régional, dérivées des données de réflectance de télédétection fournies par le produit multi capteur OC-CCI (oceancolour.org), dont les données manquantes ont été calculée en utilisant la méthode DINEOF (https://github.com/aida-alvera/DINEOF). Ces mesures peuvent être utilisées pour fournir des informations sur l'état de l'écosystème dans une zone particulière ainsi que sa variabilité temporelle, ce qui pourrait avoir des implications pour la dynamique des niveaux trophiques supérieurs. oceans true -76,39 -76,46 -65,60 -65,63 -64,65 -62.5,66 -42,66 -42,39 -76,39 0 0 5829 EPSG 2012-08-10T00:00:00 Instantaneous Water Level height - Height relative to instantaneous water level uncorrected for tide. Not specific to any location or epoch. vertical 1998-01-01T16:00:00.000Z asNeeded Generated from https://cioos-siooc.github.io/metadata-entry-form#/en/atlantic/0ZgH5TAey4fnwk04trhoypEZuJy2/-OYpdij3R8Hii9XR1qnc Oceans Government of Canada Core Subject Thesaurus 2016-10-13 N/A chlorophyll a phytoplankton remote sensing spring phytoplankton bloom chlorophylle a phytoplancton télédétection Floraison printanière de phytoplancton default phytoplanktonBiomassAndDiversity oceanColour Biomasse et diversité de phytoplancton Couleur des océans eov Open Government Licence - Canada Licence du gouvernement ouvert – Canada government-open-license-canada https://open.canada.ca/en/open-government-licence-canada WWW:LINK Use caution with data in coastal areas, in the central Labrador Sea, and in areas where contiguous pixels show large differences. In lieu of using a single pixel value over your area of interest, it is advised to use the average or median of the pixels within a radius of 20km, preferably after filtering outliers. Values with NRMSE (i.e. root mean square error of the Gaussian fit normalized to the maximum chl-a concentration) computed during the bloom duration exceeding 0.5 should be considered suspicious. Standardized anomalies exceeding 3 standard deviations from the mean should also be considered suspicious (e.g. calculated as [value-climatology_mean]/climatology_stdev for a climatology period of 1998-2024). Les données relatives aux zones côtières sont à traiter avec précaution, ainsi que la partie centrale de la mer du Labrador et dans les zones où des pixels contigus présentent des différences importantes. Au lieu d'utiliser une seule valeur de pixel pour la zone qui vous intéresse, il est conseillé d'utiliser la moyenne ou la médiane des pixels dans un rayon de 20 km, de préférence après avoir filtré les valeurs aberrantes. Les valeurs dont le calcul NRMSE (c'est-à-dire l'erreur quadratique moyenne de l'ajustement gaussien normalisé à la concentration maximale de chl-a) pendant la durée de la floraison dépasse 0.5 doivent être considérées comme suspectes. Les anomalies normalisées dépassant 3 écarts-types par rapport à la moyenne doivent également être considérées comme suspectes (par exemple, calculées comme [valeur – moyenne_climatologique] / écart-type climatologique pour une période climatologique de 1998 à 2024). Evaluation of Satellite-Based Algorithms to Retrieve Chlorophyll-a Concentration in the Canadian Atlantic and Pacific Oceans Évaluation d'algorithmes satellitaires pour déterminer la concentration en chlorophylle-a dans les océans Atlantique et Pacifique Canadiens URL https://www.mdpi.com/2072-4292/11/22/2609 An Ocean-Colour Time Series for Use in Climate Studies: The Experience of the Ocean-Colour Climate Change Initiative (OC-CCI) Une série temporelle de la couleur des océans pour des études sur le climat : l'expérience de l'Initiative sur le changement climatique de la couleur des océans (OC-CCI) DOI doi:10.3390/s19194285 ESA Ocean Colour Climate Change Initiative (Ocean_Colour_CCI): Monthly climatology of global ocean colour data products at 4km resolution, Version 6.0 ASE (Agence Spatiale Européenne) Initiative sur le Changement Climatique - Couleur de l'Océan: Climatologie Mensuelle des produits globaux de la couleur de l'Océan à 4-km de résolution, version 6.0. URL https://catalogue.ceda.ac.uk/uuid/690fdf8f229c4d04a2aa68de67beb733 A comparison of phytoplankton spring bloom fitting methods using MODIS satellite-derived chlorophyll-a concentration for the Maritimes region. Comparaison des méthodes d'ajustement de la floraison printanière du phytoplancton à partir de la concentration de chlorophylle-a dérivée du satellite MODIS pour la région des Maritimes. URL https://publications.gc.ca/collections/collection_2022/mpo-dfo/Fs97-18-340-eng.pdf PhytoFit PhytoFit DOI doi:10.5281/zenodo.4770754 Reconstruction of incomplete oceanographic data sets using empirical orthogonal functions: application to the Adriatic Sea surface temperature Reconstruction de jeux de données océanographiques incomplets à l'aide de fonctions orthogonales empiriques : application à la température de surface de la mer Adriatique DOI doi:10.1016/j.ocemod.2004.08.001 Department of Fisheries and Oceans Ottawa Canada https://www.dfo-mpo.gc.ca WWW:LINK https://ror.org/02qa1x782 Clay, Stephanie Stephanie.Clay@dfo-mpo.gc.ca https://orcid.org/0000-0001-5113-2378 Fisheries and Oceans Canada Ottawa Canada https://www.dfo-mpo.gc.ca WWW:LINK https://ror.org/02qa1x782 Devred, Emmanuel Emmanuel.Devred@dfo-mpo.gc.ca https://orcid.org/0000-0001-9446-0005 https://cioosatlantic.ca/erddap/griddap/bio_remote_sensing_occci_nwa_poly4_spring_bloom WWW:LINK Northwest Atlantic per-pixel spring bloom metrics derived from OC-CCI POLY4 satellite Chlorophyll-a, 1998-Present Par-Pixel métriques de la floraison printanière dans l'Atlantique du Nord-ouest dérivées de la Chlorophylle-a satellitaire OC-CCI POLY-4 Created with map_and_write_to_netcdf.R. Input data were 4km-resolution spring bloom metrics and annual average chlorophyll-a (chl-a) concentration per bin. Bloom metrics for each bin and year were derived from a shifted gaussian curve fitted to the time series of daily logged chl-a data within that bin. Chl-a data were taken from the POLY4 chl-a dataset which was generated using remote sensing reflectances (Rrs) from the OC-CCI multisensor product (www.oceancolour.org) and regionally-tuned coefficients, and subsequently gap-filled using DINEOF (https://github.com/aida-alvera/DINEOF). Créées avec map_and_write_to_netcdf.R. Les données d'entrée sont des mesures de floraison printanière à une résolution de 4 km et une concentration moyenne annuelle de chlorophylle-a (chl-a) par région. Les mesures de floraison pour chaque région et chaque année ont été dérivées d'une courbe gaussienne décalée ajustée à la série temporelle des données chl-a enregistrées quotidiennement dans cette région. Les données Chl-a ont été extraites du jeu de données POLY4 chl-a qui a été généré à l'aide des réflectances de télédétection (Rrs) du produit multi-capteur OC-CCI (www.oceancolour.org) et de coefficients ajustés au niveau régional, puis comblé les lacunes à l'aide de DINEOF (https://github.com/aida-alvera/DINEOF). asNeeded SDN:C17::33V4 Aqua MODIS satellite SDN:C17::33JQ Envisat MERIS satellite Suomi-NPP VIIRS satellite SDN:C17::33XX Terra MODIS satellite SDN:C17::33YO NOAA-20 VIIRS satellite SDN:C17::33QS Orbview-2 SeaWiFS satellite Sentinel-3A OLCI satellite Sentinel-3B OLCI satellite